Ta metoda profilaktyki polega na pędzlowaniu, wcieraniu w zęby roztworów, żeli i lakierów fluorkowych. Fluor uwalniany z tych preparatów wbudowuje się w szkliwo wzmacniając jego strukturę i czyni go bardziej odpornym na działanie kwasów płytki nazębnej. Ponadto fluor powoduje remineralizację drobnych ubytków szkliwa. Zabiegi fluoryzacji przeprowadza się po mechanicznym oczyszczeniu zębów za pomocą odpowiedniej pasty i po ich osuszeniu. Proces ten należy powtarzać kilka razy.

Lakiery fluorkowe utrzymują się na powierzchni zębów od kilku godzin do kilku dni. Dzięki temu zapewniają lepsze wchłanianie jonu fluorkowego do szkliwa.